Нейросеть, которая может предугадать, насколько эффективным будет редактирование генома при выборе определенного РНК-шаблона для работы с системой CRISPR/Cas9, разработана биоинформатиками. Описание разработки опубликовано в научном журнале Nucleic Acids Research.
Геномный редактор CRISPR/Cas9 был открыт в начале 2010 годов. С этого времени он много раз совершенствовался, на данный момент он дает возможность ученым с большой точностью редактировать геном.
Научный коллектив под руководством профессора Сколковского института науки и технологий Константина Северинова разработали специальную нейросеть – она позволяет оценивать успешность применения CRISPR/Cas9 еще до проведения первых опытов по редактированию структуры участка ДНК.
В нейросети были объединены математические методы, с так называемой капсульной нейросетью, которая может быстро учиться на небольшом наборе исходных данных.
В ходе работы нейросеть точно предсказывала, насколько эффективно проходит редактирование ДНК при использовании того или иного набора РНК-шаблонов. Используя эту систему, был подготовлен набор молекул РНК, позволяющих менять структуру генов 22-й хромосомы человека.
Таким образом ученые собираются подготовить оптимальные шаблоны для редактирования всех остальных участков человеческого генома. Разработка значительно упростит и удешевит работы по генной терапии для лечения врожденных заболеваний.
Ранее сообщалось, что ученые придумали, как создавать антибиотики с помощью редактирования генома.