1 сентября 2008 года распоряжением Правительства Российской Федерации Владимир Миклушевский и Александр Хлунов назначены заместителями министра образования и науки Российской Федерации, сообщила пресс-служба Минобрнауки.
Основным ориентиром в своей работе Миклушевский считает активное развитие программно-целевых методов финансирования образования и науки, обеспечение высокой степени координации федеральных и ведомственных целевых программ в сфере деятельности Минобрнауки, формирование новых финансово-экономических механизмов деятельности образовательных и научных учреждений.
Наряду с модернизацией государственного сектора науки в качестве стратегической задачи своей деятельности Хлунов обозначил разработку новых форм организации научной деятельности, в частности, национальных исследовательских центров и исследовательских университетов.