Размер шрифта
Новости Спорт
Выйти
Война США и Израиля против Ирана
Наука
ТВЗ

Гены помнят пекло

Изучение современных бактерий позволило восстановить среду обитания их предков

У учёных появился новый метод определения температурного режима и свойств атмосферы в древности. Для этого не надо копаться в скалах — достаточно внимательно изучить современные бактерии и восстановить особенности строения их древнейших предков.

До недавних пор «предсказание погоды миллиардлетней давности» оставалось уделом геологов, основывавших свои выводы на анализе химического и изотопного состава древнейших горных пород. Глубокая детализация далекого прошлого нашей планеты во многом была обязана лишь интересу и любознательности ученых: практическую выгоду из находок палеонтологов и реконструкций эволюционистов практически невозможно извлечь.

Однако, с учётом последних климатических изменений, история может помочь если и не справиться с потеплением, то хотя бы понять, как на изменения климата отреагирует биосфера.

Идея проста — если знать, какими особенностями обладают живущие в то или иное время организмы, можно сделать обоснованные выводы не только о температуре, но и о влажности, химическом и газовом составе атмосферы и гидросферы. Раньше подобные исследования ограничивались исключительно анализом биологических отложений и строения древних организмов.

Объединив геологию с генетикой и эволюцией, ученые получили новый инструмент для подобных предсказаний.

Достижения генетики, а главное — большое количество накопившихся данных о геномах одноклеточных, позволяют пойти другим путем, и судить не только об обмене веществ, но и о принципиальных чертах строения наших очень далеких одноклеточных родственников.

Принцип, предложенный американскими учеными, опубликовавшими результаты своей работы в Nature, — «у детей природы нет ничего лишнего». И если бактерии обладали той или иной регуляторной системой, значит, она им была нужна для лучшего приспособления к условиям окружающей среды.

В данном случае — это устойчивость к повышенным температурам. В отличие от многих других организмов, для бактерий «потолок» переносимых температур определяется только устойчивостью биополимеров — белков и нуклеиновых кислот. И если у многоклеточных существуют сложные системы терморегуляции, защищающие содержимое отдельных клеток от жары, превышающей 42 градуса, то белки бактерий остаются с теплом «один на один».

В случае подъема отметки термометра выше 42oC, белки денатурируют — поочередно теряют сначала третичную (объемную) структуру, потом вторичную, а затем, когда рвутся ковалентные связи между аминокислотами, и первичную, причем уже необратимо.

Определяющей в таком случае становится система синтеза и восстановления разрушенных связей между аминокислотами, за которую ответственны белки элонгации (elongation factor thermo-unstable, EF-Tu). За счет высокой энергии связей в этих белках они самостоятельно могут оставаться устойчивыми к высоким температурам и при этом восстанавливать другие, термостабильность которых практически не менялась многие миллионы лет.

Архебактерии и архей

Архейский эон, архей — геологический период перед протерозоем, закончившийся 2,5 миллиарда лет назад. Временные границы этого периода не базируются на исследованиях пород и отложений, а просто определены хронометрически. Нижней границей архея считается отметка в 3,8 миллиарда лет назад (завершение гадея), хотя она и не признана Международной стратиграфической комиссией.

Археи (Archaea, старое название — архебактерии, Archaebacteria) — особый домен (по трёх-доменной системе Карла Вёзе наряду с эубактериями и эукариотами). Оценки учёных позволяют утверждать, что суммарная биомасса архей на планете (1014 тонн) превышает посчитанную до этого биомассу всех остальных форм жизни— 2,4×1012<\sup> тонн.

Археи — одноклеточные прокариоты, на молекулярном уровне заметно отличающиеся как от бактерий, так и от эукариотов. Отличия наблюдаются в компонентах синтеза белка, структуре клеточной стенки, биохимии (только среди архей есть метаногены) и устойчивости к факторам внешней среды (большая часть — экстремофилы). Большая их часть автотрофы.

Археи широко распространены в окружающем мире, занимая, в том числе, и такие экологические ниши, которые недоступны другим живым организмам. В горячих источниках живут археи-термофилы, устойчивые к температурам +45...+113 °С; психрофилы способны к размножению при сравнительно низких температурах (-10... +15 °С); ацидофилы живут в кислотных средах (pH 1—5); алкалифилы, наоборот, предпочитают щелочи (pH 9—11). Барофилы выдерживают давление до 700 атмосфер, галофилы живут в соляных растворах с содержанием NaCl 25—30%. Ксерофилы выживают при минимальном уровне влаги.

Чтобы исследовать эти белки, ученые восстановили последовательности участков ДНК, кодировавших эти белки у архебактерий и бактерий, населявших Землю со времен архейской эры. Конечно, найти какие-либо следы настоящих древних ДНК невозможно — за миллиарды лет молекулы разрушились. Поэтому учёные восстановили их наиболее правдоподобные конфигурации, используя данные о разнообразии и родстве современных микроорганизмов. Подобный способ построения филогенетического древа «от листьев к корням» является стандартным в эволюционных исследованиях, хотя уместность его применения к определённым задачам иногда ставится под сомнение.

Далее учёные опять обратились к компьютерам. Современные средства моделирования позволяют с высокою точностью воссоздать структуру и свойства белка по последовательности аминокислот. Для подтверждения модельных выводов эти последовательности даже были синтезированы и внедрены в живущих ныне бактерий.

Для контроля метода ученые использовали современные кишечную палочку (Eisherichia Coli) и термофильную Thermus thermophilus. Как и предполагалось, оптимальные температурные условия для них чётко определяются температурами плавления белков EF-Tu — для жизни им идеально подходят температуры в 40oC и 74oC, а предел температуры среды обитания составляет 42,8oC и 76,7oC соответственно.

Итоги компьютерного анализа показали: средняя температура плавления белков бактерий-предшественников, живших в архейском эоне, была на 30–40 градусов больше, чем сейчас.

Спорным остается вопрос о глобальности обнаруженных биологами изменений в окружающей среде, ведь эти бактерии могли обитать в горячих источниках и лишь потом переселяться в мировой океан.

Бактерии испортили воздух

Причиной массового вымирания видов в конце палеозоя могли стать бактерии. Массовое вымирание на границе пермского и триассового периодов около 250 миллионов лет назад было крупнейшим в истории Земли. Тогда на планете исчезло около 85% видов морских и 65% наземных животных.

Как считают бостонские ученые, виной тому - бактерии. Причём сценарий уничтожения земной жизни существенно отличался от «Войны миров» — бактерии не паразитировали на крупных организмах, а отравили жизнь, буквально «испортив воздух», ну а заодно и воду.

Ученые считают, что этот период совпал с временем интенсивного роста фотосинтезирующих сульфобактерий, которые вместо кислорода в своей цепи окисления-восстановления используют серу, и образуя при этом весьма неприятный на запах, а в больших количествах – токсичный газ сероводород. Возможно, его стало настолько много, что на планете остались лишь те, кто мог жить в таких поистине экстремальных условиях.

Такой вывод микробиологи сделали исходя из содержания других метаболитов этих баткрий – изопреноидов в породах Западной Австралии, Восточной Гренландии и в Южном Китае.

Это возражение ученые опровергают двумя аргументами. Во-первых, обнаруженные свойства характерны для всех бактерий того времени. А во-вторых — содержание изотопов кислорода и кремния — 18O и 30Si в отложениях, сформировавшихся из бактерий, такое же, как и в мировом океане архейской эры. Эти отложения, датируемые 3,43 и 3,62 миллиардами лет, были обнаружены в Западной Австралии, что было уникальной находкой, ведь в отличие от позднего докембрия (2 500 — 542 миллиона лет назад) подобные свидетельства древней жизни очень редки.

Так что за жизнь даже в случае настолько глобального потепления переживать не стоит — прокариоты не просто сохранятся, но и будут чувствовать себя неплохо и в таких экстремальных условиях. А вот судьбе эукариот, даже одноклеточных, не позавидуешь — ведь за сложноустроенный генетический аппарат и цитоскелет нам пришлось пожертвовать способностью существовать при высоких (больше 42 градусов) температурах.

 
Большинство ИИ готовы уничтожить человечество ради себя. Это показал простой философский тест
На сайте используются cookies. Продолжая использовать сайт, вы принимаете условия
Ok
1 Подписывайтесь на Газету.Ru в MAX Все ключевые события — в нашем канале. Подписывайтесь!