Международная группа исследователей обнаружила почти 55 тысяч различных последовательностей РНК-вирусов в образцах из 102 городов и прилегающих территорий в 31 стране. Около 77% из них ранее не встречались в научных базах данных. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Communications.
Ученые проанализировали 2922 образца, собранных в 2020 году и взятых из открытых генетических баз данных. В выборку вошли мазки с городских поверхностей, в том числе поручней и билетных автоматов, а также образцы почвы, пресной воды, осадков и сточных вод.
Вместо поиска конкретных возбудителей исследователи считывали генетический материал из каждого образца и с помощью компьютерных алгоритмов определяли вирусные последовательности. Из 54 945 выявленных вариантов только 12 487, или около 23%, соответствовали уже известным последовательностям.
Большинство новых находок пока нельзя считать отдельными подтвержденными видами вирусов: ученые обнаружили генетические последовательности, а не выделили сами вирусы. Для многих из них неизвестно, какие организмы они заражают и способны ли вообще представлять угрозу человеку.
Ученые смогли предположить, какие организмы заражают некоторые из обнаруженных вирусов. Многие из них оказались бактериофагами — вирусами, которые размножаются внутри бактерий, а не клеток человека или животных.
Исследователи также обнаружили 166 бактериофагов, связанных с четырьмя видами устойчивых к лекарствам бактерий, вызывающих внутрибольничные инфекции. Эти находки могут представлять интерес для разработки фаготерапии — метода борьбы с бактериями с помощью вирусов.
Состав образцов зависел от места сбора: почва и осадки содержали более разнообразные вирусные последовательности, чем поверхности в оживленных городских пространствах. Особенно разнообразными оказались сточные воды, что подтверждает их потенциал для мониторинга микроорганизмов в городах.
Ранее бактериальный иммунитет подсказал биологам новый способ остановить старение.